制药工程实验室的主要功能是通过进行药物的合成、分离操作，使员工了解药物生产过程中常用设备的基本构造、性能和使用方法，使员工了解药物生产过程基本原理，掌握从实验室到中试、再到工业化大生产的过程方法。培养员工对工程问题分析、解决的能力以及进行科研创新的能力。
本实验室面向制药工程专业本科生，实验室配有磁力搅拌器、烘箱、循环式真空泵、超声提取仪、粉碎机、薄层色谱等仪器，能满足本科生化学制药工艺学、制药分离工程等实验教学的需求，又能满足本科生综合实验及毕业论文等的需求。
可开设的实验项目有：苯妥因钠的合成与分离、山楂中熊果酸的提取和鉴别、菠菜叶绿素的提取及色谱分离等。
